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Cancer cell：利用凝集素芯片研究肿瘤不同时期糖基化谱图的差异
发布时间：2017-09-08 10:39 | 点击次数：
目前关于糖基化的研究报道越来越多，但对于肿瘤糖基化的机制研究往往没有引起重视。肿瘤形成中很多相关蛋白都会发生糖基化的变化，但糖基化在肿瘤发展和转移过程中的形成机制尚未清楚。
本文利用凝集素芯片探索黑色素瘤转移是否与糖基化相关，并找到相关糖基化的亚类。后续通过大量的体外和体内实验，研究黑色素瘤转移与糖基化的相关机制。这一研究成果在 Cancer Cell 杂志上发表。
1. 凝集素芯片反应
通过凝集素芯片研究黑色素瘤原发灶和转移灶中哪几类糖基化的亚类发生显著变化，并找到发生显著变化的四种糖基化亚类。
本文利用凝集素芯片探索黑色素瘤转移是否与糖基化相关，并找到相关糖基化的亚类。后续通过大量的体外和体内实验，研究黑色素瘤转移与糖基化的相关机制。这一研究成果在 Cancer Cell 杂志上发表。
1. 凝集素芯片反应
通过凝集素芯片研究黑色素瘤原发灶和转移灶中哪几类糖基化的亚类发生显著变化，并找到发生显著变化的四种糖基化亚类。
2. 检测糖基化基因变化
黑色素瘤原发灶和转移灶中，检测糖基化相关基因改变。随后利用 siRNA 方法将筛选出来的基因通过黑色素瘤的细胞株进行功能验证，发现把 FUT1、FUT2 敲减掉后，肿瘤的侵袭性明显上升，而敲掉 FUT8 后肿瘤的侵袭性会明显下降。通过免疫组化发现在转移组织中 LcH 识别的岩藻糖基化表达明显升高，而 UEA-I 识别的岩藻糖基化表达是明显降低的。
黑色素瘤原发灶和转移灶中，检测糖基化相关基因改变。随后利用 siRNA 方法将筛选出来的基因通过黑色素瘤的细胞株进行功能验证，发现把 FUT1、FUT2 敲减掉后，肿瘤的侵袭性明显上升，而敲掉 FUT8 后肿瘤的侵袭性会明显下降。通过免疫组化发现在转移组织中 LcH 识别的岩藻糖基化表达明显升高，而 UEA-I 识别的岩藻糖基化表达是明显降低的。
3. 体外和体内验证：
通过体外和体内都证实了 FUT8 的表达和转移是密切相关的。敲减了 FUT8，细胞侵袭都会受到抑制。FUT8 沉默导致黑色素瘤体内侵袭能力下降，抑制体内转移瘤的生长。
4. 上下游转移机制研究：
通过 ChIP 和 Luciferase 发现，TGIF2 和 FUT8 可以发生直接的相互作用，通过转录的形式调控 FUT8 表达量，证实 TGIF2 调节 FUT8 的转录。鉴定出黑色瘤核心岩藻糖蛋白揭示侵袭和转移的调节因子，L1CAM1 是 FUT8 促侵袭调节因子。
通过 ChIP 和 Luciferase 发现，TGIF2 和 FUT8 可以发生直接的相互作用，通过转录的形式调控 FUT8 表达量，证实 TGIF2 调节 FUT8 的转录。鉴定出黑色瘤核心岩藻糖蛋白揭示侵袭和转移的调节因子，L1CAM1 是 FUT8 促侵袭调节因子。
结论:
1、利用凝集素芯片筛选出黑色素瘤转移的四种糖基化亚类类型：
2、FUT8 沉默导致黑色素瘤体内侵袭能力下降，抑制体内转移瘤的生长。
3、TGIF2 调节 FUT8 的转录，L1CAM1 是 FUT8 促侵袭调节因子。
1、利用凝集素芯片筛选出黑色素瘤转移的四种糖基化亚类类型：
2、FUT8 沉默导致黑色素瘤体内侵袭能力下降，抑制体内转移瘤的生长。
3、TGIF2 调节 FUT8 的转录，L1CAM1 是 FUT8 促侵袭调节因子。
文献链接：Agrawal P etal,. A Systems Biology Approach Identifies FUT8 as a Driver of Melanoma Metastasis. Cancer Cell. 2017 Jun 12;31(6):804-819.
凝集素对于糖链结构具有专一识别性，因此广泛用于蛋白糖修饰研究。凝集素芯片固定了56种凝集素，涵盖了几乎所有的主要凝集素，为糖基化研究提供了有力的工具（https://www.biomart.cn/infosupply/20456808.htm）。博翀生物专注于蛋白质芯片研究领域，提供最专业的蛋白质芯片产品、服务和平台，推动基于蛋白质芯片的蛋白质组学发展和蛋白质芯片的临床应用。
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